De momento lo que te responde Juan Muro es lo unico que se me ocurre,
ahora lo que podrias es optimizar el algoritmo del hittest, por
ejemplo que no busque sobre clips que esten por debajo de el sino solo
en aquellos donde su nivel de profundidad sea mayor que el del clip
que contiene el punto que deseas saber si se tapa. ya que los de abajo
serian descartados.
lo otro que podrias hacer pero q es mucho mas complejo seria trabajar
con las clases de pixel y de bitmap, pero eso depende de como estes
trabajando la distribucion de la aplicacion, otro problema que
tendrias es si por ejemplo el punto se tapa pero se tapa con un pixel
de otro movie pero que tiene el mismo color, ahi ya no te serviria.
me explico lo que se buscaria con el segundo metodo seria determinar
si el pixel del punto que quieres saber sobre la pelicula entera es
igual al pixel buscado, si no es asi esa movie esta tapada.
sin embargo considero que es mucho mas efectiva la primera solucion,
valla que puede haber mejores soluciones pero necesitaria un poco mas
de informacion sobre el proyecto.
espero te sirva.